臨床上十二指腸潰瘍比胃潰瘍更常見，最新統計數據為1.56: 1。胃潰瘍壹般比十二指腸潰瘍大。胃潰瘍和十二指腸潰瘍均常伴有慢性胃炎，胃潰瘍發病率高。
胃潰瘍最常見的癥狀是腹痛或腹部不適，通常位於上腹部的劍突下方，有時位於左側。疼痛缺乏典型的節律，腹痛發生在飯後早期。
十二指腸潰瘍的腹痛多為節律性、周期性、長期性，局限性上腹痛常發生在空腹時，尤其是早上10-11點，下午3-4點，晚上10-1點。疼痛的部位大多在劍突下的右側。周期性發作和緩解是十二指腸潰瘍突出的表現。每次發作的持續時間不壹，約壹半為2-4周，其余只有幾天，長度可達8-10周。兩次發作之間的緩解期長短也不壹樣，有的是1-3個月，有的更短，有的更長，偶爾會看到壹次發作後的緩解期長達十年以上。在緩解期，患者可以隨意進食，沒有痛苦。在很多情況下，這種周期性發作是季節性的，通常在春秋兩季，但在夏季和冬季有所緩解，這與氣候變化有關。此外，胃潰瘍可部分癌變，而十二指腸潰瘍的癌變率極低。