小羊壹旦發生細菌性腸胃炎，要及時用藥治療。可以口服痢特靈，每日每公斤體重用藥0.01克；或者口服土黴素，每日每公斤體重用藥0.05克，分2～3次服下。發現羊腹脹，拉稀不止，用乳酶生2克加炭末0.5克灌服，每日兩次；
治羊痢疾：取適量的鍋底灰，研成粉末，拌入精飼料中或直接餵服，壹次便可止痢.
防止小羊腹瀉發生，首先要加強管理。
1、是保持羊舍清潔衛生。羊群密度不要太大。勤換墊草，及時清除糞便，供足飲水，定期用10％石灰水或30％草木灰水噴灑消毒。保持羊舍幹燥清潔。
2、是合理飼餵，供足營養。選用新鮮的青草或豆科幹草，適當補充由豆餅、玉米、麥麩、食鹽、礦物質等配成的精料，定時定量飼餵，少餵勤添，避免小羊傷食。
3、是適時戶外放牧。晴天將小羊趕到戶外，讓小羊接受陽光照射，增加活動量，增加小羊體內維生素D和膽固醇的含量，促進骨骼發育，增強體質。寒流和霜凍天氣不要放牧，以免小羊受風寒或采食有霜凍的草發生腹瀉。