2食道清潔功能正常的食道，可以排空和中和唾液。酸性胃內容物反流時，通過食管的二次蠕動1 ~ 2次(10 ~ 15秒)，幾乎可以排空全部反流物。
此外，殘留食管黏膜中的少量酸也可被唾液中和。但是壹旦這種清潔功能被破壞，就會發生食管反流。
3胃十二指腸反流當幽門括約肌的張力和食管下括約肌的松弛壓力較低時，胃液中的鹽酸和胃蛋白酶、十二指腸液中的膽酸、胰液和溶血卵磷脂均可同時反流至食管，侵蝕食管上皮細胞，反流中的胃蛋白酶滲入食管組織，引起食管炎。
4食管黏膜損傷當食管黏膜損傷到壹定程度時，即使在正常反流的情況下也可能發生食管炎。這主要是因為食管黏膜受損後，上皮細胞增殖和修復能力變差，導致食管炎。