1、新疆北鯢：俗名娃娃魚，是距今3-4億年前最原始的兩棲動物物種，是目前新疆唯壹存活下來的有尾兩棲動物。新疆北鯢成體多為20厘米，晝伏夜出，因叫聲像嬰兒的哭聲，被稱為娃娃魚。
2、新疆歌鴝：在繁殖期間單獨或成對活動，非繁殖期則成群。多在地上灌叢間活動，通常離地面不超過2米，隱蔽甚好。主要以各種昆蟲為食。叫聲悅耳，非常好聽。在國內僅見於新疆。
3、扁吻魚：又名新疆大頭魚，是世界裂腹魚中的珍貴物種，有古魚類活化石之稱。被稱為“水中大熊貓”，生活在海拔800—1200米之間，地處幹旱荒漠、水位變化較大、水溫較高的靜水水體或緩流的湖泊之中。