兒童甲狀腺結節多數不能自愈，少數會自愈，因為青春期激素變化導致良性結節。兒童甲狀腺結節有20%的可能是惡性的，容易產生淋巴結轉移、肺轉移等不良表現。如果出現惡性情況，需要手術，註意定期去醫院復查。壹旦發現兒童甲狀腺結節，需要及時去醫院做彩超檢查。
要治療兒童甲狀腺結節，首先要區分甲狀腺結節是良性還是惡性。如果懷疑甲狀腺結節是惡性的或者在良性結節中比較大，並且有結節有壓迫癥狀，那麽就要考慮使用手術或者微波消融進行治療。如果甲狀腺結節沒有明顯的惡變傾向，也沒有甲亢或甲減的內分泌疾病，就要繼續觀察。如果懷疑是高功能腺瘤，這種情況也應該手術治療。