豆漿性寒，所以有胃寒，比如吃了之後消化不好，愛打嗝，有礙行氣的人，脾虛的人，比如腹瀉，腹脹的人，就不要喝了。同時，由於豆漿在體內代謝過程中會產生細胞內的核酸和尿酸，高尿酸血癥患者也不能喝豆漿。此外，腎功能不好、腎衰竭、氮血癥患者不宜喝豆漿，因為豆漿中的植物蛋白會增加腎臟的負擔。
患有急性胃炎和慢性淺表性胃炎的人不宜食用豆制品，以免刺激胃酸分泌過多而加重病情，或引起脹氣。豆類含有壹定量的低聚糖，會引起噯氣、腸鳴、腹脹等癥狀，有胃潰瘍的朋友最好少吃。胃炎、腎衰竭患者需要低蛋白飲食，而豆類及其制品富含蛋白質，其代謝產物增加腎臟負擔，應禁食。