牡蠣體內黑色的部分是牡蠣的腸腺，裏面有很多黑色的物質使那部分看起來是黑色的，而黑色的物質是牡蠣未消化的代謝產物，主要是海藻和壹些有機碎片。
牡蠣是素食軟體動物，其腸腺是各種藻類，沒有腐肉等成分，可以食用。
但是要註意，養牡蠣的水域不好，各種藻類都有汙染。吃了汙染藻類的牡蠣腸腺裏有很多汙染物，會影響身體健康。這種牡蠣不建議吃黑腸腺。
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牡蠣中黑色物質的處理:
1.不介意的人可以直接吃生蠔，也可以把外面清洗幹凈後再煮。？
2.關心的人可以用小刀或其他工具去除牡蠣的腸腺，然後用清水沖洗幹凈再食用。？
3、或者吃飯的時候不吃腸腺。