1.選菌：根據發酵劑的需求選擇合適的微生物種類。
2.預處理：選定的微生物通過采樣、分離、培養、篩選等步驟進行預處理，除去不必要的微生物，選擇出高質量的菌種。
3.發酵：將菌種接種到預處理後的發酵基質中，控制合適的溫度、pH值、營養物質等條件，進行發酵過程。
4.分離提取：發酵完成後，為了提高發酵劑的純度和活性，需要進行分離提取。將發酵液通過離心、過濾、濃縮等工藝進行分離提取，得到發酵劑。
5.制備成品：根據需求將發酵劑進行粉狀或液態的制備，存儲包裝。