1.海洋生物沈積:有機物、貝殼、珊瑚等海洋生物死亡，其骨骼和貝殼沈積在海底形成沈積層。
2.沈積層增厚壓實:沈積層逐漸堆積增厚，使下部沈積物受到高壓高溫，水分逐漸被擠出。
3.碳酸鈣結晶:水的逐漸去除使沈積物顆粒間的空隙越來越小，形成致密的巖石。
4.地質運動和形態發生:建立的壓力使碳酸鈣分解釋放出二氧化碳，從而促進碳酸鈣結晶，以地層或垂向流動的形式沈積下來。
5.石灰巖的最終形成:隨著地質運動，沈積巖被擡升形成山脈，經過風蝕、水侵和化學風化形成各種形態的石灰巖。