1、科屬不同：草菇為真菌界、擔子菌門、傘菌亞門、傘菌綱、傘菌亞綱、傘菌目、光柄菇科、小包腳菇屬真菌。口蘑為真菌界、擔子菌門、擔子菌門綱、傘菌目、口蘑科、口蘑屬真菌。
2、別稱不同：草菇有美味草菇、美味苞腳菇、蘭花菇、稈菇、麻菇等別名。口蘑有白蘑、蒙古口蘑、雲盤蘑、銀盤、營盤等別名。
3、形態不同：草菇的菌蓋直徑為5-12厘米，初期為白色，成熟過程中漸漸變為粉紅色，最後呈深褐色。口蘑的菌蓋直徑為17厘米，初期為白色，成熟過程中漸漸變為黃褐色。