萬山群島以其豐富的水產資源而成為廣東省六大漁場之壹。90年代，當地興起了網箱養殖，21世紀後，則大都采用新型的沈箱式養殖。當地漁民養殖的都是名貴魚種。其中有壹種魚叫石斑魚，喜歡生活在海底有礁石的地方，以小魚為食。聽漁民講，餵7斤小魚，這種魚才能長壹斤，再加上它的生長期較長，所有有人說吃石斑魚，往往能代表壹頓海鮮的檔次。
東澳島海產豐富，光魚類就有200多種，常見的就有70多種。其中，將軍帽、狗爪螺、石九公被稱為“東澳三寶”，美味無比。