檢測培養基是否被汙染，常用的方法是把空白的培養基，也就是未接種各種菌類的培養基。於接種後的培養基放在相同的條件下培養壹段時間，觀察是否有菌落的出現。如果出現菌落，那就說明這個培養基被汙染了。
菌落總數主要作為判別食品被汙染程度的標誌，也可以應用這壹方法觀察細菌在食品中繁殖的動態，以便對被檢樣品進行衛生學評價時提供依據。