相當於動物的下水，主要功能是扇貝的消化系統和排泄系統。有排出的廢物、毒素、重金屬或沈澱物，這些都是不可食用的。
如果誤食，可能會有異味或有沙泥感，可能會引起口腔不適。如果扇貝沒有完全煮熟，這些物質進入人體後可能更容易感染致病菌，出現惡心、腹瀉、腹痛等癥狀。
扇貝的可食用部分是白色的內向肌，有紅色或白色的生殖腺和裙邊，而消化腺和鰓是不可食用的，所以最好在烹飪前去除，以免汙染其他可食用部分。