辣椒素對胃黏膜有保護作用，可能與其增加胃黏膜血流量、促進胃動力、調節胃酸和前列腺素分泌等因素有關。
辣椒素是辣椒的活性成分，對包括人類在內的哺乳動物有刺激性，可引起口腔燒灼感。辣椒素及壹些相關化合物也叫辣椒素，是辣椒產生的次生代謝產物。或許是為了威懾食草動物，普通鳥類對辣椒素並不敏感。純辣椒素是壹種疏水、親脂性、無色無味的結晶或蠟狀化合物。