1994黃花魚被列入《中國生物多樣性保護行動計劃》二級重點保護物種名錄，2004年被中國環境發展國際合作委員會中國物種多樣性工作組紅色名錄列為瀕危物種。
黃花魚喜歡生活在淺水區，也常見於海邊的回水區或大石頭之間水流較緩的地方。冬天，它潛伏在深潭和石縫裏。適應性強，對生活條件沒有嚴格要求，小池塘、淺水湖泊都可以生活，鹹淡水也可以生活。幼魚孵化後，成群遊動，多在河口淺水區。