東寨港保護區內***有鳥類多種，其中珍稀瀕危、屬國家二級保護的鳥類有褐翅鴉鵑、小鴉鵑、黃嘴白鷺、黑臉琵鷺、白琵鷺、黑嘴鷗等。
有海南巨松鼠、海南水獺、犬蝠等獸類動物等，其中海南水獺為國家二級保護動物。兩棲動物主要有斑腿樹蛙、變色樹蜥和澤蛙等；爬行動物以蛇類為主，主要有金環蛇、眼鏡蛇、蟒等。區內的魚類大多具有較高經濟價值，如鰻鱺、石斑魚、鱸鯛魚等；大型底棲動物主要有沙蠶、泥蚶、牡蠣、蛤、螺、對蝦、螃蟹等，具有較高的經濟價值。
黑嘴鷗