壹般來說，有些種類的珊瑚真菌是有毒的，例如珊瑚真菌(帚狀真菌)在某些情況下是有毒的，如果誤食可能會中毒。中毒癥狀包括腹痛、腹瀉等嚴重的胃腸道癥狀。但也有壹些種類的珊瑚菌是無毒的，比如大腳菇、三八菇。這些無毒的珊瑚菌可以食用，有美容、抗癌、增強免疫的功效。
所以如果吃了珊瑚菌，需要確認細菌是否有毒。如果不確定是否有毒，最好避免食用。如果出現中毒癥狀，應立即就醫。