臭豆腐在發酵過程中容易被微生物汙染，還含有大量揮發性堿性酸和硫化氫，對人體有害，不宜多吃。壹次吃太多，腸胃不好的人會拉肚子。
湖南的臭豆腐，壹寸見方，壹進油鍋就有點香味。等到顏色變黑，表面膨脹，就可以撈出來，澆上蒜汁，醬油醋，腌蘿蔔條，辣椒，妙不可言。
北京臭豆腐，沒有油炸，看起來像豆腐腦，壹個個疊在壇子裏，香味很濃，是很好的佐料。