1.將蕓豆洗凈，去殼，放入沸水中煮壹分鐘，撈出放入冷水中冷卻，除去面包屑，浸泡三至四分鐘，然後撈出豆瓣，與面粉混合，在簸箕中均勻鋪開，放入發酵室中發酵，溫度控制在40度左右。
2.六至七天後，豆瓣菜上長出黃色黴菌，初步發酵完成。
3.將發黴的豆瓣放入陶罐中，同時加入5.75公斤鹽和25公斤清水，攪拌均勻後翻面。白天翻缸(即攪拌翻缸)，晚上暴曬(露天)，但註意避雨。
4.40到50天後，豆瓣菜變成紅棕色。加入碾碎的鮮胡椒粉和剩余的鹽，攪拌均勻，然後存放發酵3至5個月，豆瓣醬就完全成熟了。好的豆瓣醬發酵的時間會比較長。
高品質的郫縣豆瓣醬就是如此，不僅需要優質的原料和復雜的工藝，還要經過近1年的自然發酵，才能吸收天地精華，口感醇厚綿長。