王不留行種子的主要副作用是過敏。服用王不留行種子後出現過敏癥狀時，患者會突然出現頭暈、頭痛等癥狀，反復發作，使患者感到非常痛苦。而且臉會變紅，好像剛運動完。有出血過敏副作用的患者，最好去醫院采取有效措施處理過敏問題。
王不留行種子最明顯的作用是改善月經不調的癥狀。女性在生理期出現月經紊亂甚至閉經癥狀時，可以服用此藥。是壹種非常適合女性服用的中草藥。當然，王不留行籽還可以活血化瘀，消腫止痛，也有可能用於外傷感染。王不留行種子也可以作為輔助藥物，幫助改善婦女產後缺乳的癥狀。這是壹種催乳藥。平時女性朋友可以服用王不留行種子養生，效果不錯。