雙頭蛇屬於壹卵雙胎，在發育過程中由於受環境等因素影響，形成了畸形卵。也可能是原因在於蛇的基因（控制頭的部分）不穩定，容易發生變異，也就是變異蛇。
可以初步斷定雙頭蛇屬於壹卵雙胎，在發育過程中由於受環境等因素的影響，形成了畸形胎。過量使用化學藥劑、農藥、化肥等對環境造成汙染，都可能引發這種基因突變。
擴展資料；
雙頭蛇出現案例
1、2008年7月初，美國緬因州的壹居民發現壹只雙頭蛇。這條蛇長著兩個頭，軀幹等各部分器官卻只有壹副。
2、2009年10月15日，中國霸州農民邱宗豹在農村壹間舊房子的墻根下發現了壹只雙頭蛇。
3、2015年7月6日，南寧市動物園的蛇園出現雙頭中華眼鏡蛇，別名又稱舟山眼鏡蛇。這條雙頭蛇除了胃等消化系統、生殖系統是***用的以外，分別有各自的大腦、心臟、眼睛、舌頭等器官，從蛇的頭部至身體六厘米處是分開的。
參考資料來源；百度百科-雙頭蛇