1，形態特征不同
蕪菁:蕪菁是二年生草本植物，高達90厘米。肉質根白色或黃色，球形，扁圓形或有時長方形，須根多生於根下的直根上。莖直立，上部有分枝，基生葉綠色，羽狀深裂，狹長，長30-50厘米。
芥菜疙瘩:60-150 cm高，全株無毛，略結霜；塊根圓錐形，直徑7-10 cm，壹半在地上，皮白色，根肉質，白色或黃色，味辣，半地下，兩側有1縱溝，須根長在其中；莖直立，從基部分枝。
2、成長環境不同
蕪菁:喜涼怕冷，不耐暑。生育適宜溫度為15-22度。
芥菜疙瘩:芥菜疙瘩喜歡寒冷潮濕的氣候，不耐霜，不耐熱。高於25℃時，生長緩慢，品質差，尤其是大面積裹芥菜疙瘩品種。
3.分布範圍不同。
蕪菁:阿富汗，巴基斯坦，外高加索。
芥菜疙瘩:中國各省都有栽培。模式標本從歐洲采集。