離子交換色譜是利用具有離子交換性質的物質作為固定相，利用其與流動相中離子的可逆交換性質來分離離子化合物的方法。
凝膠色譜
原理是固定相是多孔凝膠，各組分的分子大小不同，對凝膠的阻滯程度也不同；即蛋白質大小不壹，凝膠上有大小不壹的孔；大的蛋白不進洞直接在凝膠裏下來，速度最快，中等大小的進大洞下來慢。蛋白質，人小，進入大小孔，速度最慢下來。
凝膠色譜也稱為分子篩過濾和排阻色譜。其突出的優點是色譜所用的凝膠屬於惰性載體，不帶電荷，吸附性弱，操作條件溫和，可在較寬的溫度範圍內進行，不需要有機溶劑，在保持被分離組分的物理化學性質方面有獨到之處。對高分子材料有很好的分離效果。