很多人喜歡生吃三文魚，所以也給了很多細菌寄生的機會。生吃不僅不會殺死它們，反而會讓它們進入人的胃裏，最後讓身體生病。因為是生食，很多人的胃可能會受不了。吃多了，很可能導致腸胃受損，腹瀉，疼痛等問題。
還需要註意的是，三文魚體內最多的寄生蟲是異突線蟲。如果三文魚處理不當，雜色藻的含量會更多。如果人體吃得少，可能只會引起過敏，但如果吃得多，很可能會導致食物中毒。所以三文魚有沒有寄生蟲，要看三文魚本身的處理方法。處理得當可以殺死這種寄生蟲，但處理不當會影響三文魚體內寄生蟲含量的增加。
飲食禁忌；三文魚最好不要和水果壹起吃。雖然沒有明確的報道，但是海魚盡量不要和水果壹起吃，因為它的成分和水果中的元素是相互破壞的。三文魚+濃茶:可能不利於腸胃營養的消化吸收。