哈密瓜不僅營養豐富，而且具有很高的藥用價值。哈密瓜具有清涼解暑、生津止渴的作用，是夏季佳品。吃哈密瓜能顯著促進人體造血功能。根據中醫記載，哈密瓜的根、莖、葉、花、果、梗、皮、籽都可以入藥。《本草綱目》記載，冬瓜有“止渴除煩清熱，利小便，疏三焦澀氣，治口鼻瘡”之功效。《神農本草經》將其瓜蒂列為上品藥材。該果肉有助於利尿、解渴、除煩清熱、防暑防癌，可治療發熱、中暑、口渴、小便不利、口鼻生瘡等癥狀。如果人們經常感到身心疲憊，坐立不安，或有口臭，可以清熱，緩解幹燥。現代醫學研究還發現，哈密瓜和其他瓜類的花梗含有苦味毒素，會誘發嘔吐。因為它們可以刺激胃粘膜並引起嘔吐，適當的口服可以幫助急救食物中毒，而不會被胃腸道吸收。