壹般不需要治療。如果位於皮膚外露部分，可以通過激光、冷凍、化學剝脫等方法去除。如懷疑惡變或病理檢查，需手術切除。
外科療法
如果色素痣有癌變風險，或者位於面部等特殊位置，嚴重影響患者美觀，也可以手術切除。手術方法包括:手術切除縫合、手術切除聯合自體皮瓣轉移修復缺損、手術切除聯合自體或異體皮瓣修復。
其他治療
1，激光療法
根據激光的選擇性光熱效應原理，瞬間高強度輻射能量集中在黑色素和痣色素組織顆粒上，直接汽化粉碎，再通過淋巴組織排出體外，從而達到祛除色素痣的目的。
2.冷凍療法
冷凍的液氮作用於咖啡斑表面，使局部組織瞬間凍結，痣細胞和色素細胞壞死，從而達到去痣的目的。
3、化學剝離
是利用化學剝離劑對皮膚產生可控損傷，使局部組織被破壞，刺激膠原蛋白重組，從而去除色素痣。