木瓜為灌木或小樹，高5-10米，樹皮成片脫落；小枝無刺，圓柱形，幼時具柔毛，不久脫落，紫紅色，二年生枝無毛，紫棕色；冬芽呈半圓形，先端鈍，無毛，紫褐色。葉片橢圓狀卵圓形或橢圓狀長圓形，疏生倒卵形，長5-8厘米，寬3.5-5.5厘米，先端急尖，基部寬楔形或圓形，邊緣銳鋸齒，具刺，腺齒，幼時下面密被黃白色絨毛，不久脫落無毛；葉柄長5-10毫米，被微柔毛，腺齒；托葉膜質，卵狀披針形，先端漸尖，邊緣腺齒，長約7毫米。
花單生於葉腋，花梗短而粗，長5-10毫米，無毛；花徑2.5-3厘米；萼筒鐘形外面無毛；萼片三角狀披針形，長6-10毫米，頂端漸尖，邊緣有腺齒，外部無毛，內部密被淺棕色絨毛，反折；花瓣倒卵形，淺粉紅色；雄蕊多數，不及花瓣的壹半長；花柱基部合生，具柔毛，柱頭頭狀，具不明顯的分裂，約等長於雄蕊或稍長。