6月1582日晚，光秀率領13000人的部隊從丹波龜山市出發，向京進軍，2日淩晨過桂川。光秀給士兵下達了進攻本野寺的命令，決定背叛織田信長。本野寺守軍不足百人，信長戰敗，自焚。森蘭丸為此犧牲了，明智光秀立即進軍京都。京都衛戍部隊信長的長子織田信忠來到二條宮與明智光秀作戰。很快，信長知道自己被打敗了，他被剖腹而亡。
6月5日，日光秀進入安圖市。7日，朝廷派出特使訪問明智光秀。9日，正準備前往京都時，接到豐臣秀吉回師李的消息，出兵山崎。03年6月13日，光秀歸隊，與豐臣秀吉、丹羽長秀、織田信孝等並肩作戰。在天王山(又名山崎合戰)。由於士兵人數少，加上各部大多會選擇支持羽柴軍，智者軍大敗。光秀循著小路逃到阪本，卻在當天深夜在小古魯蘇遇刺身亡。重傷的光秀讓家臣溝負責人Shobee介紹失誤。
有壹種說法是，光秀化名天海，出家隱居。其短暫的政權被稱為“三日之界”。