至於適應癥，壹般認為:重度骨髓衰竭(重度再生障礙性貧血，老年人除外)，粒細胞淋巴細胞在75%以上；最好在確診後3個月內做；20歲以下；移植前輸血較少者最好不要輸血，以減少移植後的排斥反應。無明顯感染；HLA組織配型也壹樣。
移植前的準備:大部分供體是患者的兄弟姐妹，但兄弟姐妹中任何壹個組織配型相同的幾率只有25%。即使HLA配型和MLC(混合淋巴細胞培養)合適，也會有壹些未知的、二次移植的抗原會引起免疫排斥，可能導致移植失敗。因此，再生障礙性貧血患者的免疫系統在移植前必須處於“完全”抑制狀態。壹般移植前給予大劑量環磷酰胺。
骨髓移植:從供體的多個骨髓中提取骨髓組織(混有血液，約800ml)，其中至少含有6543.8+億個骨髓有核細胞。過濾後，進行靜脈註射。移植後2 ~ 3周，如果供者的血細胞出現在患者的血液循環中，說明骨髓移植已經初步成功。需要註意的是，骨髓移植後還沒有生根。
之前患者有嚴重感染和出血的危險，所以必須對胃腸道、口腔、皮膚采取嚴格的無菌隔離和滅菌措施，防止細菌和黴菌感染。
如果有感染的跡象，就要多次輸註濃縮白細胞，並給予大量抗細菌和黴菌的抗生素。同時，為了防止出血，需要輸註濃縮血小板。
骨髓移植失敗的原因:移植前患者因家屬供血而致敏骨髓供者主配；在骨髓移植生根之前，嚴重感染或出血未得到控制；移植物抗宿主病(GVHD)是指對患者皮膚、肝臟、胃腸道等組織的急性或慢性損害。，在移植組織存活並繁殖後，其中具有免疫功能的細胞與患者原組織中的抗原發生反應。大約70%的移植患者會發生，其中壹半會死亡。所以移植後給予大劑量甲氨蝶呤或環孢素抑制GVHD反應，急性期給予全血清，療效較好。