蒲公英的根比較好，因為它的藥用價值大部分在根裏。能清熱解毒，消腫散結，消癰散結。治癰時，可搗成泥，用醋調成糊狀。可用於乳房外部，用於治療乳腺炎和乳房結節。還可用於治療咽喉腫痛、眼腫、毒蛇咬傷、濕熱黃疸。治療黃疸時，可將蒲公英根、雞內金放入粉末中，壹次壹勺，壹日兩次。
清熱解毒，如果在流行性病毒的侵襲下感冒了，可以把蒲公英葉泡在水裏喝。蒲公英葉含有大量的蛋白質和維生素，能清熱降火，提高免疫力，對緩解感冒癥狀有很好的效果。其次，蒲公英的根最大的作用是調節肝功能，驅逐肝火。其實蒲公英的葉和根都有清熱去火的作用，只是葉去體火，根去肝火。像壹些肝火旺盛的人，可以堅持喝蒲公英根浸泡的水，達到養肝的效果，可以有效緩解肝火旺盛引起的口臭、失眠等癥狀。
此外，蒲公英根還能促進膽汁分泌，幫助消化吸收。如果有消化不良的情況，也可以用蒲公英根。首先是要註意蒲公英浸泡的水量。有些人會為了更快見效而大量飲用蒲公英浸泡的水，這樣會本末倒置，不僅得不到任何好處，還會因為用量過大而引起胃部不適、惡心、嘔吐甚至腹瀉。註意，在選擇喝蒲公英泡水之前，壹定要確定自己對蒲公英不過敏，因為有的人對蒲公英過敏，喝了之後會出現蕁麻疹等過敏現象。所以對蒲公英過敏的人壹定要慎重選擇使用蒲公英泡水。