2.種子消毒:種子消毒是防治許多傳染性病蟲害最經濟有效的方法，是苗期防治病蟲害不可缺少的措施。由於種子處理的用量很小，而且距離黃瓜收獲的時間很長，幾乎不存在農藥殘留的問題，因此也是推廣使用無公害蔬菜的重要措施。
①種衣劑:種衣劑含有殺滅種傳病害和地下害蟲的殺菌劑和殺蟲劑，促進種子萌發和黃瓜生長的微量元素肥料和植物生長調節劑。現在壹些商品種子出廠前已經包衣，不需要消毒。
(2)溫湯浸種:溫湯浸種是利用幹種子和病菌對高溫的耐受性不同，通過高溫殺滅種子表面病菌的方法。將幹種子放入55-60℃的溫水中，不斷攪拌，不斷加入熱水，保持水溫在55-60℃10分鐘。降溫至28-30℃，然後浸種4-6小時，再將種子洗凈發芽。
③化學藥劑浸種:先用72.2%刺克水溶液或800倍25%甲霜靈可濕性粉劑浸種20分鐘，可防治黃瓜苗期真菌性病害。其次，用50%福美雙可濕性粉劑500倍液浸種20分鐘，可防治炭疽病和莖枯病。第三，用2.5% ZL懸浮種衣劑包衣消毒，既能殺滅潛伏在種皮中的病原真菌，又能滲透到種子內部殺死入侵種子的病原真菌，有效防治瓜類苗期猝倒、猝倒等病害。第四，為了防止種子攜帶病毒，引起病毒病，可以用10%磷酸三鈉溶液浸泡種子20分鐘。第五，1萬單位農用鏈黴素浸泡500倍稀釋液2小時可預防細菌性病害。