在20世紀後期獲得高質量的吸管並不容易，大多數都是裝在聚苯乙烯泡沫塑料或紙質容器中出售的。所以現代的生產方法是將蒸熟的大豆與人工培養的納豆菌混合，然後直接放入容器中發酵。大豆以外的壹些食物也可以做成納豆。
在制作清酒時，如果生米不慎被納豆菌汙染，釀造所需的酵母就會因其繁殖速度快而受到抑制。清酒釀造處不允許使用納豆，其他發酵食品也可能有類似情況，所以在工藝上要多加註意。
納豆菌是弱酸性的，會阻礙乳酸菌產生乳酸。技術上已經開發出了淡臭味的納豆，但由於使用了活性較低的納豆菌種，容易造成其他細菌的繁殖空間。另外，納豆菌的天敵是會寄生細菌的噬菌體病毒，噬菌體開始作用後會降低納豆菌的活性，並可能導致其他細菌開始繁殖，所以要避免食用超過保質期的納豆。
補充說明:
納豆法將洗凈的黃豆浸泡在約3倍的水中10-12小時。漲到2倍左右的黃豆放高壓鍋裏大火煮30分鐘左右。壹般鍋要煮3個小時左右。容器內鋪3-4層紗布，加入納豆菌。可以用粉末狀的納豆菌，也可以買壹些市面上賣的納豆混合在壹起。納豆菌增殖的適宜溫度為40度。所以要保證40度。用被子蓋在酸奶機或電腳爐上，發酵8小時左右，然後放入冰箱1周。，參考:zh。* * */wiki/% E7 % B4 % 8d % E8 % b 1% 86，