可可粉是生產咖啡和巧克力的主要原料，也可用於生產含有可可的高檔巧克力、蛋糕、餅幹、鏡子等烘焙食品。純可可粉是制作巧克力蛋糕的必備材料，不同於超市裏賣的加糖加奶粉的可可飲料顆粒。
制作巧克力蛋糕時，面粉中常加入20%的純可可粉。因為可可粉是酸性的，大量使用會讓巧克力蛋糕變酸。所以經常會加入少量的小蘇打來中和它的酸性，讓巧克力蛋糕的顏色更深。
天然可可粉和堿化可可粉的另壹個重要區別是不同的PH值。天然可可粉的PH值壹般在5.0-5.8之間；堿化可可粉的PH值壹般在6.2-7.5之間。天然可可粉的顏色多為淺棕色；堿化可可粉的顏色為棕紅色，過堿化可可粉為深棕色或棕黑色，添加食用色素的可可粉顏色為深黑色。
可可粉的細度對巧克力的生產非常重要。細度不合格的可可粉生產的巧克力口感差，手感粗糙。由於加工工藝的原因，堿性可可粉的顏色比天然可可粉的顏色要深。隨著堿化程度的增加，顏色會更深，如黑可可粉，但風味會相應減弱，所以黑可可粉更多用於配色，用多了堿味會更重。
無論是天然可可粉還是堿化可可粉，劣質可可粉口感幹燥、有砂粒、香氣差，但有壹個決定性因素導致了風味相近的可可粉價格仍然相差甚遠，那就是脂肪含量。脂肪可以釋放味道。制作可可熱飲、蛋糕、餅幹時，脂肪含量較高的可可粉會使口感更順滑，更具“巧克力味”，風味均衡。