1，第壹豆合約交割標準為非轉基因大豆，而第二豆包含世界各地的大豆，包括轉基因和非轉基因大豆。
2.標準不同。合同號黃大豆1采用以現行大豆國家標準為基礎，以純粒率為核心分級指標的食用大豆指標體系；黃大豆2號合同采用基於油用大豆國家標準的大豆提油指標體系，以粗脂肪含量為核心分級指標。
3.交付物的範圍是不同的。黃大豆合約1只允許非轉基因大豆參與交割；大豆2號期貨合約允許轉基因大豆和非轉基因大豆參與交割。
4.合同定價和交付包裝是不同的。合同定價方面，1號大豆合同價格包含包裝材料，2號大豆合同價格不包含包裝材料。
關於包裝，考慮到進口大豆以散裝進口和流通為主，大豆2號合約采用散裝和袋裝方式，兼顧進口和國產大豆的不同包裝方式，而大豆1合約僅采用袋裝包裝方式，與現貨流通中國產大豆的袋裝方式壹致。
擴展數據:
從這幾年國家對國產大豆的政策思路來看，政府對國產大豆的保護並不積極，這就涉及到國產種植面積的問題。目前國內耕地面積不足以保證大豆完全國產的情況下，在優先發展口糧作物的背景下，放棄油料作物是必然的選擇。
政府只維持最低限度的國內供應，但在下遊消費方面，雖然國家對轉基因作物有嚴格控制，但並不鼓勵優先宣傳非轉基因作物。這壹政策有其自身矛盾的深層次原因，短期內不會有根本性的調整。
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