DNA分子標記的優點是:大部分分子標記是顯性的，對於隱性性狀的選擇非常方便；基因組變異極其豐富，分子標記的數量幾乎是無限的；在生物發育的不同階段，不同組織的DNA可用於標記分析；分子標記揭示了DNA的變異；
它是中性的，不影響目標性狀的表達，與不健康癥狀沒有連鎖關系；該檢測方法簡單、快速。隨著分子生物學技術的發展，DNA分子標記已有幾十種，廣泛應用於遺傳育種、基因組作圖、基因定位、物種親緣關系鑒定、基因庫構建、基因克隆等方面。
擴展數據
標記，染色體上可以被識別的區域(如限制酶切點、基因位置等)。).可以檢測標記的遺傳。標記可以是染色體中具有表達功能的部分(如基因)，也可以是不編碼蛋白質功能但其遺傳特征可以被檢測到的部分。
蛋白質標記可分為:
未預染色標記是寬分子量蛋白質標準品、高分子量蛋白質標準品和低分子量蛋白質標準品；
預染標記有單色預染和多色預染。
在西方？在印跡的過程中，分子量標記就像壹顆螺絲釘，雖然是壹個小細節，但就是這樣壹個小細節對實驗結果起著重要的作用。
蛋白質印跡參照家族的成員主要用於指示蛋白質帶的分子量。只有標準量準確，實驗結果才有說服力。此外，蛋白質標準品還可以指示轉移成功或蛋白質在凝膠上的電泳程度，因此選擇正確的蛋白質標記物也是western blot實驗成功的必要條件之壹。
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