瓦罐貯藏采收菱角後，除去鱗莖表皮的汙垢和雜物，除去患病和受傷的鱗莖，鋪在磚地上12 ~ 15天，適當晾幹，將菱角放入室內大瓦罐中(不允許用腌制的瓦罐，瓦罐應放在幹燥幹燥的地方。每缸貯量約為80 ~ 100 kg，裝滿菱角的陶缸口被蓋住。需要註意的是，存放在陶罐裏的菱角，在存放初期有很強的呼吸作用，壹定要揭開缸蓋，以利於通風，放出罐裏的水；在雨季，由於空氣中濕度較大，菱角體內的水分會迅速增加，應及時揭開蓋子排出濕氣；在濕熱季節，由於水分蒸發較快，要及時覆蓋，防止菱角鱗莖內的水分蒸發而引起幹腐。在存放過程中，存放在陶罐中的菱角每隔25 ~ 30天要翻面檢查壹次。用上述方法貯藏，荸薺的保鮮期可達半年以上。
采收儲存在細沙中的菱角後，在陰涼的房子或地下室用磚砌壹個埋坑，坑底鋪5-7厘米厚的細沙，將菱角鱗莖排列在幹沙上，用細沙覆蓋3-4厘米，然後按上述方法將菱角鱗莖排放在沙上。該方法具有良好的貯藏保鮮效果。
溶液貯藏保鮮:將采集的荸薺鱗莖清洗幹凈，迅速浸入次氯酸鈉溶液中貯藏。據試驗，在溫度0 ~ 2℃，相對濕度98% ~ 100%的貯藏環境下，荸薺鱗莖的保鮮期可達10個月，5℃下保鮮期可達6 ~ 8個月。