但網上壹直流傳蕨菜和蕨根粉致癌的說法。也有研究指出，蕨菜有很強的致癌性。
2010著名民間科學組織科學松鼠會在網上發表了壹篇關於純天然野菜致癌的文章。食品工程博士雲博士在文章中指出，蕨菜並非傳說中的“安全”、“無公害”、“抗癌”功能，而是具有明確的致癌性。
另外，網上有壹篇文章說萊柏食品安全實驗室進行了這個課題的實驗。經過壹系列實驗，得出結論:蕨菜確實致癌，具有很強的致癌性！
貴陽醫學院藥理教研室黃等專家在《蕨菜致癌作用的實驗研究》中指出，用鮮蕨菜和苦蕨菜餵大鼠，處理蕨菜和苦蕨菜幹粉7個月後，四組分別有6只動物(33.5%)、3只動物(18.75%)和2只動物(12.5%)。同時，鮮甜蕨組和處理過的苦蕨組分別有1只動物。另外，用上述四種蕨菜勻漿灌胃接種艾氏腹水實體瘤的四組小鼠10天，結果顯示給藥後瘤體增大，增重率分別為30.27%、11.01%、4.59%和1.83%。
萊柏食品安全實驗室通過國際上最先進的LC-MS(液相色譜-質譜)檢測發現，蕨菜中不僅含有苯草酸、蕨內酰胺、黃烷醇類化合物、菖蒲黃素類化合物，還含有強致癌物鳳尾蕨苷！
實驗數據還顯示，這些致癌物在蕨菜根莖中的含量最高，其次是葉片。其中，甜菜夜蛾的irubin超標37倍，苯草酸超標22倍。
根據萊柏食品安全實驗室對蕨菜的動物飼養試驗，蕨菜可誘發大鼠胃癌、腸癌、乳腺癌、膀胱癌和白血病。
“萊柏食品安全實驗室”的研究人員也表明，即使是加工過的蕨菜也可能致癌。在烹飪過程中，蕨菜中致癌物質的分子結構不能被破壞，甚至還發現了其他壹些可能致癌的新化合物。