傳教士利瑪竇非常聰明。他最初研究孔子的時候，把孔子想象成中國的宗教領袖，比如壹些中東國家的伊斯蘭教異教領袖。然而，利瑪竇非常謹慎。他仔細研究了中國封建社會儒家思想的內容和孔子的核心。然後他根據孔子的壹些著作和壹些經典故事，發現孔子並不是壹個宗教領袖，而是壹個非常有思想的哲學家。孔子思想的傳播，就是孔子在傳播壹種哲學思想，類似於古希臘的壹些哲學家。
利瑪竇發現這壹點後，帶領傳教士不要盲目反對儒學。但是從儒家的角度，讓中國封建社會的人更好的理解基督教和儒家的相似之處。利瑪竇傳播基督教的方式贏得了明朝壹些文人的青睞。其中壹個重要人物就是徐光啟。
利瑪竇采取的這些措施使明朝壹些人很快接受了基督教的存在。但當利瑪竇向西方天主教會報告中國傳教情況時。許多人也追隨利瑪竇的壹些傳教方式。它並不否認儒家思想的正當性，同時調節西方思想與儒家思想的沖突，但這種想法受到了羅馬教會很多人的質疑。羅馬教會有些人認為儒家的壹些思想和方式與異教宗教領袖沒有區別，孔子就是宗教領袖。利瑪竇的傳教方式被否定。
利瑪竇的傳教思想在羅馬教會受到批判，但他的方式在中國是成功的。他的傳教思想在壹定程度上符合儒家思想。