主要區別是，科目分類不同、形態特征不同、產地生境不同，具體如下：
壹、科目分類不同
1、霍斛
霍斛壹般指霍山石斛，屬微子目、蘭科、石斛屬、霍山石斛種。2、石斛
石斛，又名仙斛蘭韻、不死草、還魂草、吊蘭、林蘭、禁生等。天門冬目、蘭科、石斛屬、石斛種。
二、形態特征不同
1、霍斛
莖直立，肉質，不分枝，具3-7節，淡黃綠色，有時帶淡紫紅色斑點，幹後淡黃色。葉革質，2-3枚互生於莖的上部，斜出，舌狀長圓形。總狀花序1-3個，從落了葉的老莖上部發出，具1-2朵花；花淡黃綠色，開展，花瓣卵狀長圓形，先端鈍，具5條脈；唇瓣近菱形，長和寬約相等。花期5月。2、石斛
莖直立，肉質狀肥厚，稍扁的圓柱形，上部多少回折狀彎曲，基部明顯收狹，不分枝，具多節，節有時稍腫大；節間多少呈倒圓錐形，幹後金黃色。葉革質，長圓形，先端鈍並且不等側2裂，基部具抱莖的鞘。總狀花序從具葉或落了葉的老莖中部以上部分發出，具1~4朵花，花梗和子房淡紫色，花大，白色帶淡紫色先端，有時全體淡紫紅色或除唇盤上具1個紫紅色斑，藥帽紫紅色，圓錐形，密布細乳突，前端邊緣具不整齊的尖齒。花期4~5月。
三、產地生境不同
1、霍斛
生於山地林中樹幹上和山谷巖石上。產中國河南西南部（南召）、安徽西南部（霍山）。模式標本采自安徽（霍山）。
2、石斛
野生多在疏松且厚的樹皮或樹幹上生長，有的也生長於石縫中。產安徽南部大別山區、臺灣、湖北南部、香港、海南（白沙）等。
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