1.挑選清洗大豆:去除異物、蟲蛀的豆子、未成熟的豆子、結疤的豆子等。洗掉沙子，石頭，黃豆的汙漬。清洗時請註意不要弄傷黃豆，手要輕拿輕放。
2.浸泡大豆:浸泡大豆用的容器，容量應是大豆的4倍以上。壹旦浸泡，生大豆會膨脹2倍左右。所以排出的水量應該是黃豆的3倍左右。泡黃豆的地方要避免陽光直射和高溫高濕。水溫15℃，浸泡時間約18小時。這個容器裝有250克大豆和750毫升水。
3.煮黃豆:用樹籬把泡好的黃豆挑起來，控制水分。蒸、煮黃豆時，最好用拇指和小指輕輕撚黃豆。如果用高壓鍋蒸可以節省時間。
4.滅菌:將煮熟的黃豆放入已滅菌的容器中，立即加入事先準備好的納豆菌(約70-90℃)，用已滅菌的勺子攪拌。(如果大豆冷卻後再加入菌液，就會失效。).容器裝滿後，用無菌布蓋好，蓋上蓋子。
5.發酵:酸奶機作為發酵室(發酵納豆的加熱裝置)，可以在培養箱中恒溫保溫，但要保持與大氣相通。為了促進發酵，最好提前將發酵室的溫度調整到38℃左右。掌握發酵溫度的標準，應保持在40℃，連續發酵22 ~ 24小時。
6.熟化:為了停止發酵，使納豆有異味，要在5℃以下的冰箱中保存壹夜，使其成熟。發酵納豆表面附著壹層灰色粘液，用筷子攪拌的絲可以拉出20多厘米長，有獨特的氣味。吃之前，用筷子攪拌。攪拌時間越長，粘度越大，口感越好，產品質量越好。
7.保存:冰箱可以保存5天。冰箱可以保存壹年。