這片土地是煉金術士王霸的住所。後來，王霸在皂莢樹下“虛度光陰”，永垂不朽。據《福建通誌》記載，唐貞元中期，觀瞻使李若初登塔，在王霸住處見五色彩雲飄向天空，遂在原址建碑。唐憲通八年(公元867年)的觀察使李靜雯邀請常沙安禪師在此建寺。兩年後改名清禪寺，不久又改名延壽寺。元朝的方丈是佛坑和道姐。明朝第二年(1437)，僧人決定重修西禪寺。經過十年的哀悼(1637)，梁明大師再次重建了它。明朝的方丈也有程序和方明這樣的奇才。清初，空音、吉雲等禪師先後在西禪寺居住，並對其進行維護。光緒三年至十五年(1877-1889)，精微禪師多方集資重建。隱逸禪師，又名姚遠，來自福建仙遊縣。西禪寺15歲。
出家後在湧泉寺待了十年。同治末年回到西禪寺，只見大殿荒廢，大雄寶殿三寶佛頭戴帽子遮風擋雨。微妙，我決定重建西禪寺。1876年，他去北京修各種經典，光緒皇帝送給他壹本《龍藏》和壹本《藥理學家經典》。然後，微妙去了新加坡。
新加坡、馬來西亞、印度、緬甸、菲律賓、泰國和臺灣省。回國後，他主持修建了新的佛經亭，重修了大雄寶殿、祖殿、天王殿等30余座大殿，形成了今天西禪寺的規模和格局。在壹些華僑的要求下，精微禪師在寺內紀念園旁建了壹座媽祖宮(又稱天後宮)，供奉媽祖神像。19
28年，智水方丈和監制梁錚重修寺廟，加建園亭，開辟花園和放生池。今天花園裏有數百顆古老的荔枝。西禪寺的荔枝“皮薄輕，味清甜”，從唐代開始人們就爭相評論。歷代文人墨客都來嘗梨，留下了許多奇聞軼事和詩詞歌賦。西禪寺每年仍舉行荔枝聚會，名流學者吟詩作畫。《壹山池莉》成了艷遇。抗日戰爭時期，西禪寺的天王堂、大乘殿、方丈室、念佛堂均毀於炮火，後由監獄的梁錚、範輝集資修繕。抗日戰爭時期，西禪寺被日軍飛機轟炸，後被該寺的監獄和新加坡、馬來西亞、越南等國的下院認證。
積極籌措修復資金，基本維持原有布局。十年“文革”動亂，西禪寺再次被搶，所有佛像被毀，大殿被占。65438年至0979年，西禪寺在省、市政府落實宗教政策後重新開放。1982國務院正式批準西禪寺為全國重點開放寺廟。海外華人聞訊，紛紛回國朝聖。譚禪、青禪、法禪、、大仙、李光前、李承毅，以及鄭格如和他的兒子郭鶴年、郭鶴舉，都慷慨解囊，修繕寺廟，並建造了玉佛塔和報恩塔，擴大了西禪寺的規模。