造成大小年的原因有很多，比如氣候影響，比如暖冬和春季澇災，這是造成大小年的原因之壹，也有遺傳和生理原因，但最主要的原因是荔枝樹的營養調節不適應，施肥管理措施不到位。
比如荔枝高產後，消耗了大量的養分。如果沒有補充足夠的養分，就不能形成新的結果母枝，或者因為新梢拔得太晚，組織太嫩，新梢沒有積累足夠的養分供應花芽分化所需的養分，第二年就不開花不結果，變成小年。小年果實少，營養相對較多，容易產生大量結果母枝。在適宜的條件下，花芽分化良好，第二年就會結出大量的花和果實，成為大年。
新年過後，如果不加強荔枝果園的管理，就會形成新的壹年。這種大年小年的循環，是荔枝樹營養、生長、結果不平衡造成的。
在荔枝樹營養中，碳水化合物和氮是花芽分化的前提，是重要的營養和能量，澱粉積累在花芽發育中起重要作用。碳氮比大時，有利於花芽分化和開花。反之，碳氮比低時，不利於花芽分化，秋梢不能開花，或出現花穗沖花。
根據彭劍(2004)對糯米糍、桂味、妃子笑、黑葉、胡愛芝的研究結果，各品種早年葉片澱粉和總糖含量顯著低於新年度同期，秋梢葉片碳水化合物不足，含氮量過高和碳氮比過低都會影響次年樹木的生殖生長。在花芽分化期和坐果期，大齡樹葉片中硝態氮含量高於小齡樹，但在花期低於小齡樹。大樹齡的樹葉中磷、鉀含量基本較高，容易裂果，如糯米糊、桂味等。大樹齡樹葉的鈣含量較低，而小樹齡樹葉的鈣含量較高。要促進結果枝生長，按時成熟，儲存足夠的碳水化合物，提高秋梢開花率。