自然災害是目前不可避免的自然風險，人類無法抵禦自然災害對食用菌產業的破壞力。而中國幅員遼闊，不可能全國同時發生壹般的自然災害。應盡量利用現有的科技手段避免自然災害，減少自然災害對食用菌產業的危害。食用菌產業發展有序，有可能以循環產業促進發展，提高投資成功率。不能因為食用菌產業受自然災害影響大，食用菌產業風險大，就減少對食用菌產業的投入。
食用菌產業投資有兩種風險是可以盡量規避的。壹個是國內市場或國際市場變化引起的風險；前幾年國外市場的蘑菇事件教會了我們很多；在中國，山東雞腿菇事件給了我們壹個沈重的教訓。壹個是國家政策變化帶來的風險。只要掌握市場經濟規律，隨時監控市場變化，及時調整自己的市場策略，爭取市場的主動權，就有可能從投資中獲利。成功的投資利潤可以彌補部分損失。因此，投資者和經營者必須同時掌握國內市場和國外市場。他們不僅要采取走出去的戰略，還要培育國內市場。面對金融危機，他們應該規避最大的風險，避免嚴重的損失。
只要認識和掌握市場經濟規律，善於觀察市場見風使舵，投資食用菌產業的風險就可以大大降低。目前，相當壹部分金融機構規避投資食用菌產業等風險，導致國家產業政策無法落實，影響食用菌企業發展。讓既懂金融又熟悉食用菌產業和市場經濟規律的人做決策者，是解決食用菌產業投資風險的重要措施之壹。
在我國，農村人才匱乏、菇農文化素質和法律意識低下是阻礙食用菌產業快速發展的瓶頸，也是食用菌產業投資風險最大的因素。這裏有四個問題。壹是技術人才缺乏導致食用菌行業整體技術水平低；二是管理人才缺乏導致食用菌產業現代化管理水平低；三是人力資源開發利用水平低，導致食用菌行業人才流失嚴重；第四，貸款對象的企業法人的信用判斷能力。這四個問題是食用菌產業投資成功的關鍵環節。而這四個問題在銀行投資(貸款)的規則中大多被忽略，缺乏嚴格的監管，導致投資失敗的銀行壞賬。
項目是食用菌產業投資風險的重要組成部分。目前，好的食用菌產業化項目很少，大多數食用菌企業市場意識差，缺乏專業人士為食用菌產業策劃設計具有市場運作價值的投資項目。我國食用菌產業發展的潛力和空間很大，因此食用菌產業投資的潛力和空間也很大。如何發掘這個投資金礦，是壹個亟待解決的問題。筆者認為，促進食用菌產業發展應采取五大策略。壹是品牌戰略，二是人才戰略，三是集約化經營戰略，四是科技戰略，五是走出去戰略。促進食用菌產業發展應采取三項措施。(1)市場環境問題:重點建設食用菌大市場和大流通。②政策環境要符合支持發展的良好政策環境，真正落實黨中央、國務院的政策措施。(3)健康發展的文化環境也是保證現代食用菌產業規避風險的重要環節。