長野公共衛生汙染研究所進行的實驗表明，納豆的提取物可以將3萬個致病性大腸桿菌從0-157減少到40個以下。最近的科學實驗也證實，納豆芽孢桿菌對0-157相似致病性大腸桿菌0-11、0-144以及金黃色葡萄球菌、沙門氏菌、李斯特菌等其他致病菌具有相同的抑制作用。抗菌機理是納豆菌能產生殺菌物質吡啶二羧酸。
調理腸胃，潤腸通便，排毒養顏。
納豆菌不受胃液強酸影響，在腸道內迅速定植。納豆菌產生的吡啶二羧酸能有效殺滅和抑制腸道內的有害細菌和病毒。使腸道菌群達到健康的動態平衡，快速解決便秘、腸炎、腹瀉等問題，給妳壹個健康的腸道。所以納豆菌的通便效果是立竿見影的。我們都知道50%到80%的糞便是腸道細菌和他的身體。腸道細菌活躍時，大便就會通暢。這就是通便的原因。每天大便壹次，可以清大便，排除毒素。此外，納豆激酶可以溶解毛細血管中的血栓和脂肪，從而確保面色紅潤。
顯著改善女性更年期綜合癥
大豆異黃酮是主要的植物雌激素之壹，具有微弱的雌激素樣作用。納豆中30毫克異黃酮相當於大豆中100毫克異黃酮。女性的更年期癥狀和絕經後骨質疏松癥主要是由於體內雌激素水平下降引起的。大豆黃酮能補充體內雌激素不足，不僅能明顯改善更年期癥狀，還能防治女性骨質疏松。考慮到納豆的解毒、美容、減肥作用，納豆對於女性來說是非常重要的保健食品。
緩慢減肥直觀上降低餐後血糖。
納豆芽孢桿菌可在腸道內持續存在約1周，可促進其他有益菌的增殖。腸道細菌，重約1 kg。當然，它需要誘餌。人體吸收的營養成為腸道細菌的誘餌，被吞噬。另外，納豆激酶可以燃燒脂肪，所以可以減肥。還有納豆粘稠物質，起到浸出和包裹的作用。所以納豆減肥緩慢有效，不會反彈。但很直觀的是，餐後血糖值呈明顯下降趨勢。壹種是納豆菌吞噬葡萄糖和粘液，另壹種是納豆中的彈性蛋白酶(或胰蛋白酶E)抑制血糖升高。它與豬胰腺中所含的這種酶具有作用，並且來自豬胰腺的彈性蛋白酶已被用作高血糖癥的治療藥物。
解酒和護肝
納豆激酶進入人體後，通過三個渠道構建酒精保護屏障:進入人體肝臟系統，分解肝臟解酒壓力，幫助解酒；進入人體血管系統，在腦血管區域形成關鍵的保護屏障，抵抗酒精對大腦的抑制作用；進入人體消化系統，迅速形成保護屏障，加速消化道泌酸，促進解酒。服用納豆可以快速解決飲酒後的不良反應，防止隔天醉酒。此外，納豆中的多種活性物質激活肝細胞，促進肝細胞再生，改善肝功能，保護肝臟，有效預防和改善脂肪肝。所以日本流行壹句諺語:“喝酒的時候多吃納豆，防止醉兩天。”
高血壓的預防
對於遺傳性高血壓的小鼠，對照組(大豆)的血壓逐漸升高至33.3Pa(250mmHg)，而加納豆的小鼠血壓保持正常，為65438±08.7 kPa(65438±040 mmHg)。這是因為納豆菌食品中含有血管緊張素轉換酶(ACE)抑制劑，會阻止血管緊張素變成活性形式。
預防飛蚊癥
納豆菌食品對眼睛有非常好的保健作用。它不僅能凈化血液，溶解堵塞在眼球微血管中的血栓，還能減少膽固醇在血管壁的堆積。此外，它還有利於預防白內障。
降低膽固醇和預防動脈粥樣硬化
動物實驗證實，納豆菌食品能抑制血液中LDL氧化，有效降低總膽固醇和甘油三酯的濃度，進而減少動脈粥樣硬化的發生。推測納豆菌食品具有這些功效是因為其抗氧化成分含量高。