關於螺旋藻的副作用，其實是調試反應，也叫好轉反應
有些人開始食用螺旋藻，經過數日之後，可能會有拉肚子（壹天數次軟便）、放屁多、發暈、倦感、白天嗜睡等現象發生，就驚惶“是否發生了副作用”，其實這絕對不是副作用，而是屬於正常的“好轉反應”（又稱為“回憶反應”，中醫學稱為“螟眩反應”）。
好轉反應發生的原因:
1、螺旋藻對身體有強效排毒功能。
食用後將體內產生的毒素、老廢物或異物由糞尿或皮膚排出體外，因此排尿量會增加，大便也會變成水狀，也有從皮膚排毒等狀況，皆因人體內潛藏之代謝廢物量而異。
2、螺旋藻對人體器官的修復作用。
螺旋藻使過去正在休息或功能衰退的的器官再次恢復機能（例如腸開始動作而剝離、收縮，便會帶來腹痛）；螺旋藻將體內的毒素移動而發生的疼痛（如風濕病痛、濕疹等的壹時性增加）。
好轉反應的經過:
好轉反應通常在3-7天左右，但因個人服用量、生活習慣、年齡、病癥、體質、健康狀況不同而有所差異。
身體狀況較差的人，有時好轉反應不會全部發生，而是逐漸地在不同部位發生，這也是身體狀況相當不好的證據。例如∶為了改善頭痛而食用了螺旋藻，結果首先因頭痛而擔憂，不久發生腹痛，這表示腸內也有潛伏的毛病。
好轉反應的現象
1、輕度的好轉反應
有發暈、倦感、肩硬、拉肚子(壹天數次的軟便，不會出現腹痛)、放屁多(壹天數十次)等特征。
2、重度的好轉反應
有頭痛、發腫、頭暈、發燒、濕疹、關節痛、血壓壹時上升、喘不上氣、嘔吐、食欲不振等。
3、主要的好轉反應如下 (以下只是壹般好轉舉例作為參考)
酸性體質者∶嗜睡(在白天)、喉幹舌燥、尿頻、放屁多。
血液淡者∶因體質而異、但有輕微的流鼻血(以女性居多)
肝不良者∶想嘔吐，有時會嘔吐，皮膚會痕癢或出疹現象。
腎臟病者∶有蛋白質暫減少的情形，臉部會有水腫情形。
胃不好者∶胸口發悶，不易咽下食物。
胃潰瘍者∶不良的部分會痛。
胃下垂者∶胃部總覺得不適，想嘔吐。
腸道不良者∶有下痢癥狀，但依病情而異。
高血壓者∶頭暈的狀太態持續壹至二星期。
肝硬化者∶有時會有大便帶血的情形。
痔 瘡 者∶有時會有壹時出血的情形。
如何對待好轉反應？
當妳服用螺旋藻後有上述情況出現時，切勿因壹時的不適而放棄，請耐心地對待好轉反應，反應消失後，身體將變得輕松，以往的病癥也隨之消失。這就象生銹的鐵管內倒入除銹劑壹樣，壹時會流出很多臟的銹水，以後將變得幹凈。根據調查至少需要服用 200克以上的螺旋藻，其效果可達百分之九十以上。只要有信心，定能顯出神奇功效。
若效果不顯著，需檢查以下各點∶
1、食用螺旋藻時，是否有斷斷續續的情形，或食用量是否足夠。（因個人的體質與環境不同，服用量也因人而異。我們建議日常保健每天服用5克左右，康復治療每天服用 10克左右）。
2、起居飲食是不協調（過多酸性食物、煙、酒、精神壓力或刺激）。
3、缺乏適當的運動。