湯姆有幾個孩子:喬奇、本和吉姆，但鎮上那個臟兮兮的流浪兒哈克跟他最投緣。哈克的父親是個酒鬼。如果任其自生自滅，他就成了壹個無依無靠、遊手好閑的“野孩子”。在鎮民眼中，他是個無賴，而孩子們都認為他是個有趣的夥伴。湯姆把當海盜的想法告訴了哈克。哈克說海盜都是勇敢的人，他們同意半夜去墓地試試勇氣。
湯姆騙月經睡覺，和哈克壹起去了墓地。在陰風下，他們目睹了壹場打鬥:喬殺了壹名醫生，並嫁禍給喝醉的彼得。兩個孩子都害怕兇猛的喬，互相發誓絕不說話。
勇氣受到了考驗。湯姆和喬治帶著從家裏“偷”來的食物，把哈克叫到密西西比河邊，找到壹只小木筏，劃到下遊的傑克遜島。這裏荒無人煙，成了三個“小海盜”的快樂大本營。晴朗的夜晚，明亮的星星，灌木叢，篝火野餐；沒有大人的訓斥，沒有牧師的訓誡，沒有法官的威嚴，沒有老師的懲罰，有沙灘，有草原，有樹林，有鳥兒，有松鼠，有蝴蝶...他們無憂無慮，無拘無束，這裏簡直就是世外桃源，凈土！
鎮上的人找了好幾天，急得找不到孩子，漸漸絕望。周日，鎮民在教堂為他們三人舉行了追悼會。就在人們悲傷的時候，牧師發現三個調皮的男孩若無其事的進了教堂，來到了他們的親人身邊。
鎮上將要對彼得謀殺案進行審判。湯姆和哈克出庭為彼得作證，喬嚇壞了，拔腿就跑。湯姆和哈克成了鎮上的英雄。
湯姆的冒險心從未消失。他知道傳說中的海盜會把寶藏埋在那棵枯萎的老歪樹下，他和哈克要去尋寶。有壹天，他們在鬼屋翻箱倒櫃的時候，真的遇到了壹個鬼——喬和壹個陌生人來到這裏，把偷來的金幣藏了起來。兩個強盜商量著把這些金幣壹起藏在“十字二號”下面，這些話被躲在樓上的湯姆和哈克聽得清清楚楚。
湯姆的同桌貝基是鎮法官撒切爾先生的女兒。她求父親邀請同學去山裏露營，孩子們坐輪渡去鎮外的山裏。
大家來到了有趣的莫克托洞穴。魚貫而入的孩子們對這個陰森神秘的洞穴既好奇又有點緊張，就連愛冒險的湯姆也是第壹次來。山洞裏的岔路口像個迷宮。孩子們在洞裏玩耍、吵鬧，從不同的方向聚集在洞口。
但是湯姆和貝琪在山洞裏迷路了。湯姆壹心想成為壹名探險家，他帶著貝茜在山洞裏轉了壹圈，再也沒有出來。貝基很害怕。這個男孩的勇氣和智慧給了湯姆信心。他安慰貝基，耐心地尋找洞穴的出口。
在山洞裏，湯姆偶然遇見了喬！喬已經是壹只受驚的鳥了，他害怕聽到湯姆的動靜。湯姆和貝琪終於找到了出口，並和他們的親戚壹起去了。休息了五六天之後，湯姆去法官家拜訪貝琪。撒切爾先生告訴他:為了防止任何人再次迷路，木刻洞的出口被封了。湯姆說山洞裏有壹個逃犯喬！
鎮上的人們再次湧向莫克托爾山洞，看到喬已經死在山洞裏多日了。
湯姆·哈克又來到山洞尋寶，終於在刻有十字記號的大石頭下挖出了喬埋的金幣。
湯姆和哈克劃著船回到鎮上。他的奇遇會給鎮上的人帶來多麽大的震撼啊。