引起尿痛的生殖疾病有尿道炎、非特異性陰道炎、黴菌性陰道炎、子宮肌瘤等。針對這些生殖疾病我們也可以采取相應的措施治療它，這樣就可以避免誘發尿痛。如尿道炎可以在醫生指導下選用川心蓮片、八正合劑等中成藥服用；非特異性陰道炎：①糾正陰道酸堿度。②註意合理應用廣譜抗生素及激素等。
治療尿痛首先要控制急性感染，同時配合硝礬洗藥外洗；根據尿道外口的局部情況決定治療方案，如小陰唇融合者，行小陰唇分離術；若尿道外口有肉阜狀突起，則將其切除；對融合型者，行尿道口陰道口間距延長術；對遠端尿道狹窄者，定期行尿道擴張術。
尿路感染（簡稱尿感）根據感染部位不同分為上尿路感染和下尿路感染，上尿路感染指輸尿管、腎盂感染，也稱為腎盂腎炎，下尿路感染即膀胱炎或尿道炎。上下尿路感染均可有尿頻、尿急、尿痛、排尿困難、伴或不伴肉眼血尿，尿常規中白細胞明顯增多，中段尿細菌培養可陽性。兩者最大的區別在於腎盂腎炎除上述癥狀外可表現為寒戰、發熱、腰痛、腎區叩擊痛，典型的出現白細胞管型。
尿痛是臨床上常見的癥狀，女性尿痛比男性多見。尿痛的原因很多，需要加以區別。女性尿痛最常見原因是尿路感染包括腎盂腎炎、膀胱炎和尿道炎，另外陰道炎、老年萎縮性陰道炎、外生殖器感染、間質性膀胱炎、化學刺激（水泡浴、避孕凝膠、沖洗、藥物）、尿道肉阜或憩室、膀胱收縮和括約肌松弛以及膀胱腫瘤等都可造成尿痛。男性尿痛可以有前列腺炎、尿路感染、性病（淋病、沙眼衣原體感染）等。
既然尿痛有以上那麽多原因，所以壹出現尿痛就服用抗生素是不妥當的，應當及時到醫院就診，查明原因。如果是尿路感染，也應該先作清潔中段尿培養，根據藥物敏感試驗結果選用有效抗生素正規抗炎治療，以免濫用抗生素造成細菌耐藥，或出現服藥時癥狀緩解、壹停藥癥狀就復發的情況。
開發壹種新的抗生素壹般需要10年左右的時間才能投入使用，而壹代耐藥菌的產生只需1年左右的時間，由此可見抗生素的研制速度遠遠趕不上耐藥菌的繁殖速度。由支原體，衣原體感染引起的非淋病是壹種性傳播疾病，此病是80年代傳入中國，已有20的年歷史，病菌早已變異，變異的結果是抗藥性更強了，這就是有些人染上非淋久治不愈的主要原因。任何壹種抗生素如果使用不合理，大量的濫用，過不了幾年就會失去它本身應有的作用，就會使有些病菌變得刀槍不入。就拿青黴素這個老牌抗生素來說，過去得了扁桃體炎，打點青黴素就好了，可現在鏈球菌對青黴素耐藥了，使青黴素變得無效了，怎麽辦？醫生就用更高檔更新的抗生素，結果還是不行，就這樣壹級壹級的住上升，走進了惡性循環的怪圈。更可怕的是抗生素的毒副作用，據有關資料統計，中國每年有20萬人死於抗生素的不良反應，其中有40%死於抗生素濫用。由些可見，非淋、淋病患者不能長期大量反復使用抗生素，如果長期大量反復使用，不但治不好病，還會使病情加重。非淋、淋病患者對此壹定要高度重視。中國的中醫中草藥在這方面有著得天獨厚的優越條件來解決耐藥菌的問題。