鴨嘴獸壹生以浮遊動物為食，浮遊動物與中國鱅魚壹樣，是濾食性魚類。枝角類，尤其是水蚤，是白鱘最喜歡的食物，搖蚊幼蟲等小型水生昆蟲偶爾也會吃。全長不到12 cm的魚，壹條壹條吞食浮遊動物，小魚小蝦。當總長超過12 cm時，它們的攝食器官發育良好，轉而進行濾食性。