1，體型不同:芝麻刀魚體型較大，呈流線型，頭部扁平，嘴長而尖，而叉尾魚體型相對較小，身體扁平，尾部分叉，有兩個明顯的下鰭。
2、尾部形狀不同:芝麻旗魚的尾部是扇形的，而叉尾魚的尾部是剪刀尾。
3、胡須顏色不同:芝麻旗魚的胡須是白色的，而叉尾魚的胡須是黑色的。