1.科屬不同:日本鯖屬於鯖科中的鯖屬，而日本鯖屬於鯖科中的鯖屬。肉質不同:鯖魚緊實，口感好；青鯖魚又粗又硬，口感不如鯖魚。
2.體型差異:兩者的體型也不同。鯖魚相對較大，從25-50厘米長到300-1000克重。但黑鯡魚體型較小，體長20-40cm，體重150-400g。